湖南省儿童医院感染科成立于1987年，拥有独立的门急诊、发热门诊及病房，设床位64张，配有呼吸机、心电监护仪、床旁摄片机、传染病专业防护物品等相关设备物资。是湖南省级重点专科、湖南省儿童应急救治中心，且是湖南省卫生主管部门指定的儿童感染和手足口病诊治定点单位及儿童新冠肺炎排查单位。感染科现有医护人员共计39人，其中医师14人、护士25人。医师情况：硕士研究生6人，其中正高3名、副高8名、各阶段参与的课题项目《成功抢救人禽流感儿童患者的急诊救治模式》及《重症手足口病的早期识别及救治研究》分别获2006年湖南省科技进步二等奖、湖南医学科技奖特别奖及2008年湖南省科技进步三等奖。近年主持多项湖南省卫生健康委和湖南省科技厅科研课题，获实用新型发明专利1项。2020年全员参与新冠疫情防控，获得湖南省卫健委“三八红旗岗”，2020年湖南省儿童医院抗疫“先进集体”年度“先进集体”，“新冠肺炎疫情防控医师团队先进集体”等荣誉。2021年科室荣获“全国五一巾帼标兵岗”称号。2021年“免疫抑制并水痘-带状疱疹病毒感染”MDT团队荣获医院优秀MDT团队三等奖。